集体土地房屋拆迁是分开进行补偿的，一方面是对集体土地进行补偿，另一方面是对地上的房屋按照地上附着物予以补偿，而房屋价值的确定标准一般是评估。
集体土地房屋拆迁补偿标准的关键问题是在于拆迁补偿安置方案。不同地方、不同时间的房屋拆迁过程中的拆迁补偿方案都是不同的，拆迁补偿安置方案是市县人民政府土地行政主管部门制定，报市县人民政府批准的。一般来讲，如果被拆迁人集体土地房屋拆迁补偿标准不服的，可以通过法律程序进行解决，通过行政诉讼解决。另外，在集体土地房屋拆迁补偿标准的制定过程中也就要保证被拆迁人的参与权。集体土地房屋拆迁补偿标准的确定方法有：
1、房屋价值补偿标准的确定
集体土地房屋价值可以采取是否搬迁重建的方法确定补偿标准，需要搬迁重建的房屋，应该找相关专家进行重置成本评估，以确定合理的补偿标准。还有就是，对于提供土地重建安置的拆迁补偿，应该有专业的房地产评估机构来进行评估，评估中需要去掉土地使用权的补偿。
2、临时安置补偿标准的确定
在集体土地房屋拆迁补偿协商中，如果被拆迁人选择了产权置换，那么拆迁方是需要给予被拆迁人临时安置补偿与搬迁补偿的，用于在安置房无法交付时在外租房。但是相关法律法规中对于临时安置和搬迁的补偿标准没有明确的规定。大多时候是需要拆迁方与被拆迁人协商解决，如果协商不成可以找评估机构评估确定，并由拆迁方提供周转房。
3、停产停业补偿标准的确定
该项补偿和被拆迁房屋属于集体土地或者国有土地没有直接关系，要看是否有合规的营业执照等证件。停产停业损失主要包括两方面，一是由于房屋拆迁停产停业导致被拆迁人的经营损失，二是在拆迁过程中产生的费用，如设备和物品搬迁费用，以及停产停业期间员工的安置、工资等。房屋拆迁补偿标准应该对相关的经营损失和必要的费用补偿进行确定，停产停业的补偿大多是当地政府征收部门，根据当地的自身情况制定相关的地方补偿政策。
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