有房产证的房屋在征收时直接认定被征收人,对房屋的建筑面积可以按房产证面积直接认定,各项补偿和洽谈产权人无障碍的进行,而无产权证的房屋是作为产权不明的房屋首先要进行产权认定,不会直接与你签订补偿协议书,要在现场或媒体公告对房屋主张人的姓名,60天后无产权争议才进行补偿洽谈,签订协议时还要写下承诺书,如果今后有产权纠纷由签字人承担法律责任,而且对无产权证的房屋还要经规划、国土、住建三个部门来认定这房屋是不是合法建筑,如属违章建筑不予补偿。只要认定是合法建筑,确认了产权人后,对评估补偿不管有产权证还是无产权证其补偿的价值是一致的。